新疆农业职业技术学院种子生产与经营专业于1999年开办，专业形成了“服务产业链，背靠企业群，实施“大订单”的专业建设特色，已经成为自治区种业公司的人才输送基地。培养了一大批有文化、懂技术、善经营、会管理的高素质技术技能型种子生产经营人才。

经过20余年历史沉淀，专业是“双高计划”高水平专业群建设领衔专业、国家示范性高职院校重点建设专业、教育部现代学徒制试点专业、专业教学团队是国家级教师教学创新团队和全国高校黄大年式教师团队，专业获国家级教学成果二等奖3项，自治区教学成果2项。

专业目前拥有专任教师21名，其中教授6人、研究员1人，副教授7人，高级职称专任教师的比例67%，具有硕士学位及以上的专任教师的比例86%，“双师型”教师占比81%。专业有1名国家名师、2名天山英才、3名农职教名师、2名自治区教学能手。整合校内外优质人才资源，选聘企业高级技术人员担任产业导师，组建校企合作、专兼结合的教师团队，师资队伍总体水平在全国同类专业中领先。 专业毕业生初次就业率98%以上，企业满意度90%以上，创业率达到8.3%。在金苹果2021高职院校专业竞争力排行榜中名列第一。

专业建有国家级“旱区虚拟仿真实训基地”，自治区级“种子质量检测中心”能对外开展种子DNA纯度检测、遗传育种等20个集实习实训、科研服务，创新人才培养和项目孵化的产学研基地。2024年种子专业人才培养质量位居全校第一。